Ambientato nelle settimane successive a Resistance: Fall of Man, Resistance: Retribution narra la storia dell'ex marine inglese James Grayson, impegnato nella sua vendetta personale per distruggere tutti i centri di conversione. Dopo aver appreso del suo insuccesso (i Chimera infatti hanno sviluppato un nuovo metodo per convertire gli esseri umani in Europa occidentale), le forze della resistenza decidono di rivolgersi a lui. James accetta e si unisce a Cartwright e Parker nell'Operazione Overstrike.